MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus buchneri NRRL B-30929 plasmid pLBUC03

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015421	A	6	6	152	157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015421	A	6	6	234	239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015421	TAG	2	6	268	273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015421	TTTTA	2	10	290	299	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015421	A	6	6	311	316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015421	CAAG	2	8	334	341	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_015421	CT	3	6	446	451	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_015421	TA	3	6	1634	1639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015421	ACAA	2	8	1671	1678	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015421	T	7	7	1799	1805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015421	T	6	6	1830	1835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015421	AGG	2	6	1871	1876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015421	CTT	2	6	2890	2895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015421	A	6	6	2914	2919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015421	AT	4	8	2931	2938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015421	TGT	2	6	2992	2997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015421	TAA	2	6	3025	3030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015421	TAT	2	6	3046	3051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015421	GT	3	6	3061	3066	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015421	GTG	2	6	3114	3119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015421	CAG	2	6	3126	3131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015421	TAT	2	6	3209	3214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015421	A	7	7	3242	3248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015421	A	6	6	4263	4268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015421	GGT	2	6	4315	4320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015421	ATAA	2	8	4985	4992	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015421	TAT	2	6	5006	5011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015421	TTAT	2	8	5024	5031	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015421	TAAT	2	8	5500	5507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015421	GTA	2	6	5549	5554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015421	CCAA	2	8	5562	5569	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_015421	ATA	2	6	6541	6546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015421	TAA	2	6	6577	6582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015421	GCA	2	6	6620	6625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015421	TTA	2	6	6686	6691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015421	GAA	2	6	6766	6771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015421	TAA	2	6	6790	6795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015421	ACT	2	6	6833	6838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015421	ACT	2	6	6863	6868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015421	AGT	2	6	6889	6894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015421	ATAA	2	8	7000	7007	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015421	TAA	2	6	7083	7088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015421	CTA	2	6	7140	7145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015421	CAG	2	6	7149	7154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015421	TTA	2	6	7163	7168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015421	ATTC	2	8	7179	7186	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_015421	CA	3	6	7187	7192	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015421	GTG	2	6	7386	7391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015421	CTATTG	2	12	7413	7424	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_015421	TGT	2	6	7432	7437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015421	ATTA	2	8	7453	7460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015421	TAA	2	6	7491	7496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015421	AAG	2	6	7526	7531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015421	ATGA	2	8	8402	8409	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015421	ATA	2	6	8429	8434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015421	A	6	6	8474	8479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015421	TCC	2	6	8807	8812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_015421	AAT	2	6	8851	8856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015421	T	6	6	8887	8892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015421	TAT	2	6	8895	8900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015421	CAG	2	6	8909	8914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015421	TTC	2	6	8950	8955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015421	AAG	2	6	8987	8992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015421	GTT	2	6	8996	9001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015421	CTGA	2	8	9047	9054	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_015421	TGC	2	6	9130	9135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015421	TGG	2	6	9162	9167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015421	T	7	7	9232	9238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015421	AAC	2	6	9272	9277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015421	AT	3	6	9673	9678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015421	ATAA	2	8	9700	9707	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015421	T	7	7	9959	9965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015421	CTT	2	6	9967	9972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015421	TGA	2	6	10041	10046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015421	TAAT	2	8	10641	10648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015421	TTG	2	6	10708	10713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015421	T	6	6	10726	10731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.